確認いたしました。子テーマの header.php が原因でした。
Bootstrap4版では使用する class 名を変更せざるをえなかった都合上、
デザインスキンがBootstrap3かBootstrap4 かによってclass名を header.phpに直接書き込むのではなく、関数で表示を出し分けています。
具体的には旧バージョンのheader.php(及びそれを子テーマに複製した場合)では
<header class="navbar siteHeader">
となっていますが、新バージョンでは
<header class="<?php lightning_the_class_name( 'header' ); ?>">
となります。
お手数ですが親テーマのソースコードと見比べて修正ください。
【重要】Lightning 7.0 / Lightning Pro 2.0 での仕様について