ご連絡ありがとうございます。
その後アドバイスを参考にしならがら、もう一度メニューを作って、同じように「1階層ダミーページ」「2階層目ダミーページ」「3階層目ダミー」を作り、さらに新しい(ナビゲーション)メニューも作ったところ、これは無事に表示されましたので、こちらをベースに再度同じメニューを再現して無事完了しました。
結局、何が問題なのかは不明ですが、前回の再制作したメニューはブロックをコピーしてしたのですが、今回は完全にまっさらな状態から、一つづつテキストとURLを入れて作ってみました。
ちなみに、その後不具合を起こしたメニューのブロックも入れてみましたが、やはり不具合を起こし他メニューのコピーしたブロックは非表示のままです。
勝手な仮説としては、もしかして保存の際に通信状況の影響などで不完全に保存されて、結果、ナビの部分だけ壊れたのではないかなと・・・。
とにかく解決できました。
ありがとうございました。