2カラムページの横幅を変えたいです。

使用しているスキンによって対応方法が変わってきます。
（特に Bootstrap 3 ベースのスキンなのか Bootstrap 4 ベースのスキンなのかが重要です。）

【重要】Lightning 7.0 / Lightning Pro 2.0 での仕様について

なのでどのスキンを使用しているのか教えていただけますか？
スキンは 外観 ＞ カスタマイズ ＞ Lightning デザイン設定 から変更できます。

P.S.
１行あたり全角 35 ～ 40 文字あたりが読みやすいという説をよく目にします。
そこを踏まえて幅を設定したほうがいいと思います。

下記をベースに調整すると良いでしょう。

@media (min-width: 992px) {
	/*メインセクション*/
	.mainSection-col-two {
	    width: 66.6667%;
	}
	/*サイドバー*/
	.sideSection-col-two {
	    width: calc(33.3333% - 3em);
	}
}

ちなみに、66.6667% + 33.3333% = 100% となることを踏まえて調整してみてください。

定規を使えばわかると思いますが・・・
ロゴの左端はサイト全体（全幅エリアを除く）の左端と一致していて、
メニューの右端はサイト全体（全幅エリアを除く）の右端と一致しています。

なので安易にそこを変更することはおすすめできません。

あえて、メニューを段落ちさせて、ロゴを中央揃えにするのが最も早い解決策のような気がします。

@media (min-width: 1200px) {
    .gMenu_outer,.gMenu {
        float: none;
        right: unset;
        margin-left: auto;
        margin-right: auto;
    }
    .siteHeader_logo {
        float: none;
    }
    .navbar-header {
        text-align: center;
    }
}